Так, Вы все делаете прямо наоборот
1. достать из под стола(зимовать его в этом году не надо). Слабый он и маленький.
2. ставьте под лампу, чтобы ему было светло и тепло.
3. пакет оденьте. Но не плотно, воздух растению тоже нужен. Если пакет сидит плотно его придется проветривать каждый день.
4. поливать минимально, лучше опрыскивать.
5. купите в любом цветочном магазине препарат, который наз " Циркон". При опрыскивании добавляйте в воду этот самый "Циркон" по прописи(пропись на этикетки)
Дырочки в горшке-это дренажные отверстия. А дренаж, это любой материал, который кладут в горшок, чтобы вода лучше стекала и не застаивалась. В качестве дренажа можно использовать: керамзит(продается в любом цветочном магазине), просто гравий( можно купить в зоомагазине. Наз: "Грунт для аквариума"

, просто кусочки пенопласта или осколки от разбитого глиняного горшка. Короче любую субстанцию, которая не держит воду, позволяет ей легко вытекать из горшка и дает возможность корням дышать.
По Вашему описанию корней я ничего понять не могу. Главное следующие: нормальный корень должен быть белого или грязно- белого цвета. Он должен быть эластичным и не рваться в руках(проверять это надо разумеется без усилия), гнилой корень коричневого или черного цвета, пустой и иногда липкий на ощупь, буквально сразу же обрывается. Но сейчас уже не надо кидаться это проверять. Бесконечное дерганье больному растению пользы не принесет.
Сейчас главное : свет, тепло и высокая влажность( влажность, это не вода в горшке, это содержание влаги в воздухе). Вот это все и организуйте. А потом посмотрим.
Еще момент, сухость почвы проверяется сл. образом: засовываете палец прямо в почву по первую фалангу. Если влаги не ощущаете совсем, можно немного полить. Но гранаты вполне засухоустойчивые существа. Залив для них много страшнее пересушки. Удачи.