sirota, чем-то он явно болеет...
Скажу честно - я бы такое растение просто выбросила, чтобы не рисковать здоровьем остальных. Но у меня кактусов каждого вида обычно содержится в избытке, так что генофонд бы от этого не пострадал.
Пятна сверху вроде как не похожи на работу красного клещика, хотя на мелком фото было такое подозрение.
И вообще они странные... У меня такой формы пятна, но чёрные, появлялись при содержании растений в холодную погоду при повышенной влажности. Но они же у Вас не чёрные...
Нижнее пятно сбоку очень большое относительно размеров кактуса. Насколько я поняла, гниль Вы вычистили до здоровых тканей? Или всё-таки пятна коричневые оставались? В этом случае есть шанс, что гниль прошла внутрь, до самой макушки. Тогда верхние пятна - следствие развития заболевания.
В общем, я даже не знаю, что посоветовать. Фунгицидом попробуйте весь стебель обработать и грунт полить, но если кактус поражён изнутри, то эта мера ничего не даст.
А вообще - точно ли это сулькоребуция? Корни были реповидные?
Клуб любителей гибискусов FlowersWeb.info
Скорая помощь растениям, реанимация
корень реповидный...один..довольно большой...крепкий..вычистила гниль до здоровой ткани и присыпала углём..поэтому цвет чёрный...а потом ещё и фундазолом немного..размеры пятна не меняются...а свеху пятнышки были с самого начала и тоже не меняются...
..а она там как огуречик ни единого пятнышка...чудесная была сулька...так и лежит в корзинке покоцанная...я подумала...а вдруг там гниль а я её к кактусам на зимовку и все перезаражаются мало ли 
Могу и сейчас детей нащипать, но на зиму-то лучше бы не принимать новичков.
...прямо срезом сухим...а поливать надо будет или нет...?
...края моей сульки немного завернулись...начала подсыхать...думаю, что может и получиться...на вид всё очень жизнеспособно выглядит...чудесааааа 
