мда... удивляюсь, как он у вас протянул целых три года
С корнями может быть что угодно - сгнили, усохли, поражены каким-либо заболеванием. Поэтому растение нужно из горшка достать, аккуратно удалить весь старый субстрат и далее произвести пересадку по всем правилам. Возможно, потребуется обработка какими-либо препаратами. Только СНАЧАЛА почитайте про пересадку, а не потом.
То, что вы называете стеблями, не срезают, даже если листики на них пожелтели и опали. Срезают только старые полностью усохшие
стебли туберидии.
И поливают нобили, как и многие другие растения, не раз в сколько-то дней, а по мере необходимости. Необходимость в каждом случае своя.